A Coordenação garante a supervisão das atividades relativas a todos os projetos sob a responsabilidade da Unidade de Gestão de Projecto Especiais (UGPE) e na coordenação e seguimento das ações relacionadas com as aquisições de bens e serviços relativos aos Projecto. E é o responsável pela execução dos projetos sob a alçada da UGPE e assegura a comunicação com o Governo, os Financiadores, os Intervenientes diretos e todas entidades ligadas aos Projecto, por forma a evitar eventuais constrangimentos e falhas, bem como arbitrar possíveis conflitos entre os intervenientes do processo de implementação dos projetos.